本計畫分為4個子計畫執行，子計畫一「港灣構造物設計基準修訂之研究」、子計畫二「港灣碼頭與防波堤調查與維護管理之研究」、子計畫三「臺中港發展港埠物流之探討」及子計畫四「超大型貨櫃船對港埠之影響研究」。 子計畫一以本所96年版之設計基準為基礎，探討需增補與修訂之內容，以利後續報部修訂施行；子計畫二乃以花蓮港碼頭及防波堤等港灣設施，進行鋼筋混凝土及鋼構造物之現況調查與檢測評估及研擬維修工法，並優化擴充現有維護管理系統，提供未來設計與維護管理參考；子計畫三則探討臺中港發展港埠物流之情形，研擬港埠物流發展的方向與策略，據以提升港埠營運競爭力與港埠附加價值；子計畫四為探討超大型貨櫃船靠泊對高雄港港埠經營環境之影響。

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